Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms