Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms