Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM2Q9BVW6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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