Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KATNB1Q9BVA0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms