Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf50Q9BV19 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms