Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TIMM29Q9BSF4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms