Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GAL3ST1Q99999 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms