Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP8Q99708 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms