Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms