Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms