Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms