Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E2Q96LR5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E2Q96LR5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E2Q96LR5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E2Q96LR5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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