Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGBD1Q96JS3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms