Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms