Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms