Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF496Q96IT1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF496Q96IT1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms