Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms