Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms