Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPACA9Q96E40 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms