Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms