Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C18orf8Q96DM3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms