Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL4Q96C24 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL4Q96C24 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms