Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF34Q969K3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF34Q969K3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms