Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms