Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD50Q92878 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms