Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RGP1Q92546 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms