Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALLDQ8WX93 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALLDQ8WX93 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms