Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms