Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms