Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms