Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYCP3Q8IZU3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms