Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms