Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRCQ7RTU9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms