Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHA9Q7RTU4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms