Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSH2Q76I76 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH2Q76I76 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms