Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms