Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3FQ6ZSY5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms