Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC129Q6ZRS4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms