Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC2Q6ZN30 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC2Q6ZN30 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC2Q6ZN30 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC2Q6ZN30 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC2Q6ZN30 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC2Q6ZN30 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNC2Q6ZN30 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNC2Q6ZN30 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms