Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CASC2Q6XLA1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms