Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SUSD1Q6UWL2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms