Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOA5Q6Q788 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms