Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A47Q6Q0C1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms