Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms