Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC62Q6P9F0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms