Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms