Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LETMD1Q6P1Q0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms