Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms