Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms