Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REEP3Q6NUK4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms